根據中央對國有企業改革的統一戰略部署，落實海洋強國和國家“一帶一路”戰略，應對航運業嚴峻挑戰，做大做強做優，中遠和中海兩大集團推進實施了改革重組。考慮到集裝箱業務整合的艱巨性、複雜性，中遠海運集團率先對旗下兩家國内最大的集裝箱運輸公司——中遠集運和中海集運實施了深度整合。
整合後的中遠海運集運，經營308艘集裝箱船舶，運力達160.8萬TEU，運力規模全球排名第四、亞洲第一，全球員工達25000多名，旨在打造具有國際競争力的、世界一流的航運公司。
整合重生
兩家集運公司的整合是集團整合中最為錯綜複雜的項目，是集團整合成功與否的标志性項目。
班輪公司整合工程浩大、過程艱巨而複雜，業界不乏失敗案例。有的花費了很長時間才建立起統一的組織機構；有的整合過程中出現IT系統崩潰；有的客戶大量流失。
而在集團統籌指揮和兄弟公司的大力支持下，中遠海運集運充分認識整合難度，快速行動、全面融合，制定從總部到口岸、區域，再到網點、國家的整合方案和推進時間表，建立IMO推進工作機制，高效平穩推進了改革重組各項工作。2016年3月1日，新集運總部合署辦公，明确了新的組織架構，總部設立26個部門，并妥善配備了總部和國内口岸的人員。接着，在短短6個月時間裡，初步完成海内外網絡的整合。3月1日—5月1日，隻用了兩個月的時間，就完成國内網絡整合，9大口岸、近300家網點全部合署辦公，統一了領導團隊。4月12日到10月底，在集團領導下，在海外區域公司積極推動下，迅速完成了海外網絡的整合與業務對接，涉及九大區域、104個國家與地區、近5000名中外員工。2016年底前，股權交易基本完成。
在信息系統領域，妥善快速地實施了全球信息系統切換。經過9個月的不懈努力，成功實現了涉及9大領域、21個核心系統、80個項目的擴容改造，經受住了數據量在短期内倍增的嚴峻考驗。從5月在部分航線試點切換，到7月1日起全面實施，再到10月底全部訂艙切入系統，比原計劃提前了整整兩個月。整合速度創造了業界紀錄，令業内人士驚歎。
一次成功的企業整合=設計良好的整合計劃+高質量的貫徹實施。
制定計劃面臨的挑戰包括雙方地位的協調、聯盟的抉擇、IT系統差異性和能力不足問題的解決、人力資源的配置、海外法律和社會環境的适應等。
貫徹實施面臨的挑戰主要來自于保持客戶不流失、箱量不下降、業務不斷不亂的壓力、以及與合作夥伴的溝通、公共代理和合資方的選擇和業務交接、新機構的運行和磨合、文化沖突與融合等。
為确保整合快速、有序推進，集運建立了IMO推進機制，協調全球整合。集運IMO團隊根據集團明确的以“深度、快速”為原則的頂層設計方案和集運整合“十個統一”（IT系統統一、航線規劃統一、箱管統一、客戶營銷與服務統一、運價管理統一、内貿集裝箱全面統一、供應商管理統一、全球網絡及支線統一、聯盟統一、有競争力的薪酬與激勵機制統一）的重要要求，确定了具體實施方案，并堅決推進，高效執行。
集運整合方案的核心，在于促使“三張網”的合二為一：組織架構和海内外網絡的合二為一，即營銷和服務網絡整合；航線網絡的合二為一；信息系統的網絡合二為一，即操作和流程的統一。
圍繞這三張網的整合，全體船岸員工團結協作，克服重重困難，不斷解決重點難點問題，按時間表平穩高效加以推進。
整合後協同效應逐步釋放，公司效益明顯改善。
加速出發2016年我國外貿形勢異常複雜嚴峻，以美元計價的中國外貿進出口總額比上年下降6.8%。集運市場盡管運力增速略有放緩，但需求依然嚴重不足，運價加速下滑。CCFI指數于4月創下曆史新低的632點，情況比2009年金融危機時更差。面對空前的困難與挑戰，在集團的正确領導下，中遠海運集運圍繞集團精心作出的頂層設計，上下一心，主動作為，堅定不移推動改革重組，為全力以赴打好效益攻堅戰拼盡了全力。
改革重組後的2016年3－12月，新集運實現提單箱量1258萬TEU，在前所未有的市場低谷中逆市增長0.2%，基本實現了整合元年“貨量不流失”的目标，打破了咨詢公司關于整合後貨量流失10%以上的預測，更打破了“業内整合元年貨量必然下降”的慣例。整合後，新集運的單月虧損額同比整合前分屬兩家經營時，明顯收窄，11、12月更實現扭虧為盈。2016年11－12月相比2015年同期，運價、油價差距不大，外部環境并無實質差異，但效益卻有根本轉變，凸顯了整合後的規模效應。
2017年，新集運深化協同效應，充分釋放改革紅利，聚焦“增長”主題，取得了豐碩成果：全年提單箱量比2016年增長了15.5%；單箱收入增長了13.8%；單箱成本下降了2.2%；總收入增長了30.4%；利潤總額比2016年大幅扭虧為盈。從同業對标情況看，新集運也有不俗表現，盈利能力大幅提升，全年EBIT率及其增幅均高于同業。貨運量逐步趕超，特别是第三季度單季貨運量首次超越行業領先者。單箱成本降幅最大，單收實現兩位數增長。全年貨量規模和增幅雙雙領先。
整合之初，集運提出了“ABETTERONE”的口号，在整合期間貫穿始終；系統切換後，集運向外界鄭重宣告“WeAreReady”；整合完成後，立足“為客戶傳遞價值”，又提出了“WEDELIVERVALUE”。這三個語句，堪稱集運在整合重組不同階段的縮影，赢得了市場與客戶的認可與贊譽。
“不忘初心，方得始終”，中遠海運集運正朝着打造具有國際競争力的世界一流班輪公司的目标前進。