雲無心：美國生物與食品工程專業博士，科普作家，著有《吃的真相》等系列作品在早期的轉基因作物研究開發中，西紅柿是最熱門的對象。
西紅柿的軟硬很大程度上由其中的果膠決定。傳統的西紅柿中有一種“多聚半乳糖醛酸酶”，作用是分解果膠。果膠被分解了，西紅柿就失去了硬度。
美國某生物技術公司在西紅柿中的基因中插入了這個酶的反義DNA序列，從而大大抑制了這種酶的産生。這個經過基因改造的西紅柿品種被命名為“FlavrSavr”，在1992年和1994年先後獲得美國農業部和食品藥品管理局的批準，成為全球第一個被批準種植的轉基因作物。
1994年，這種不易變軟的西紅柿在美國加州的戴維斯和芝加哥上市，因為保質期更長而大受歡迎。
技術上的成功和“世界第一種轉基因西紅柿”的身份，并沒有為它帶來商業上的成功。除了保質期更長，這種西紅柿并沒有别的優勢，而且生産和運輸的成本都很高，大大降低了它的市場吸引力。
很快，其他公司推出了傳統育種得到的新品種，不僅有着類似的“不易變軟”特征，而且風味更好，價格更便宜。“FlavrSavr”這個農業發展史上具有裡程碑意義的品種，在1997年黯然退出了市場。
英國也出現了類似的轉基因西紅柿。1996年，英國一家公司推出了用它生産的西紅柿醬。跟傳統的西紅柿醬相比，這種轉基因西紅柿醬更加黏稠，而價格比傳統的西紅柿醬還要便宜20%。在接下來的幾年中，這種西紅柿醬銷售了180萬瓶，一度比傳統的西紅柿醬更受消費者喜愛。
它的失敗可以算是“躺着中槍”。當時英國有一些機構在研究轉基因土豆的安全性。本來，轉基因作物的安全性都是采取“個案審核”的方式，即一個轉基因品種怎樣，并不能擴展到另一個品種上去。而這些機構研究的轉基因土豆，隻是處于研究階段，并沒有被批準種植。它們是否存在問題，跟獲批上市的轉基因西紅柿完全無關。但是對公衆來說，“轉基因”是一個框，與這個框有關的新聞，都很容易被演繹擴展到其他的轉基因作物身上。
1998年8月，英國羅維特研究所的普茲泰(Pusztai)博士接受了一次電視采訪，介紹他關于轉基因土豆的大鼠實驗。普茲泰稱，喂養轉基因土豆的大鼠小腸上皮組織比對照組的厚，他認為這與免疫能力有關，而且可能是土豆的轉基因操作導緻的。他表達了對這些轉基因土豆的疑慮，認為應該做更多的實驗來評估其安全性。
這次采訪立即引起了軒然大波，許多媒體跟進，并把它演繹成了“轉基因有害健康”的驚人結論。羅維特研究所随即對該項研究進行了調查，結論是這項研究的數據并不支持普茲泰博士在電視上宣稱的結論。羅維特研究所暫停了普茲泰的工作，拒絕跟他續簽工作合同，引起了22名各國科學家的聯名反對。
英國皇家學會也組織對這項研究進行了評議，并于1999年2月公布結論，認為這項研究從實驗設計到數據解讀都存在問題，得不出作者的結論。1999年5月，《柳葉刀》雜志發表了一篇評論，對各方都進行了批評。
這項研究跟轉基因西紅柿沒有關系，而且研究本身也存在諸多問題，但普通公衆不可能去深入了解其中的是非曲直。當有足夠多的消費者對它産生疑慮，商家就推出了非轉基因西紅柿醬來迎合市場需求。1999年後，這種轉基因西紅柿醬就消失了。
此後還有一些轉基因西紅柿獲得了商業化種植許可，比如一種耐儲存西紅柿。
但是，通過傳統育種也得到了具有類似特征的品種，它們更容易被市場所接受，所以在跟轉基因品種的競争中取得了先機。
後來的轉基因西紅柿瞄準了更多獨特的特性，比如抗凍、耐旱、耐鹽、抗蟲等，還有一些提供營養、改善風味、甚至産生某些口服抗體或者活性多肽的轉基因西紅柿也在研究開發之中。